本发明公开了一种采用离子液体强化萃取分离叶黄素和玉米黄质的方法，包括以下步骤：以离子液体水溶液作为萃取剂，以生物柴油作为溶解叶黄素和玉米黄质的原料相，以生物柴油作为洗涤剂，进行多级分馏萃取得到萃取相和萃余相；萃余相中加入正己烷使叶黄素结晶析出、过滤，滤渣分别用正己烷、水洗，冻干后得到叶黄素；萃取相用生物柴油进行反萃，得到富玉米黄质的生物柴油相，加入正己烷使玉米黄质结晶析出、过滤，滤渣分别用正己烷、水洗，冻干后得到玉米黄质。本发明的方法选用了绿色无污染的离子液体、水以及生物柴油构筑三元液液两相萃取体系，为今后相似天然类胡萝卜素混合物的大批量高效分离提供了可行性方法。

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