本发明公开了一种用于模拟复杂分层流动水体的装置及其模拟方法，包括多路循环水槽和多路流率闭环控制系统，所述多路循环水槽包括方形水槽，在方形水槽一内侧面设置有多个进水模块组，在方形水槽内进水模块组相对一侧面设置有多个出水模块组；所述多路流率闭环控制系统包括用于控制进水模块组进水的进水模块流率控制系统和用于控制出水模块组出水的出水模块流率控制系统，蓄水池内的水依次通过进水泵、进水模块流率控制系统打入进水模块组，出水模块组的出水经过出水模块流率控制系统、真空抽水泵进入蓄水池。本发明可以在同一水槽中构建出多种复杂水流形态，具有适应性强，重现性好、重构流场相似度高、控制方法简单等优点。

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